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　  新聞網(wǎng)訊 近日，公衛(wèi)學院繆小平教授課題組,，在腫瘤基因-基因交互作用研究領域取得了重要進展,。相關研究成果“A polymorphic MYC response element in KBTBD11 influences colorectal cancer risk, especially in interaction with an MYC- regulated SNP rs6983267”發(fā)表在國際腫瘤學重要雜志Ann Oncol((IF:11.8))上?？娦∑浇淌跒樵撐耐ㄓ嵶髡?，青年教師龔靜博士和2017級博士生田劍波為該文的第一作者。該成果為揭示腫瘤復雜分子機制提供了新思路,。

　　MYC是一個經(jīng)典的癌基因,，也是一個重要的轉錄因子，可以調(diào)控10%左右的基因表達,，其通過影響細胞增殖凋亡,、分化,、細胞侵襲轉移、血管生成以及宿主基因組不穩(wěn)定性等眾多分子機制過程,，參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展及其演變,。該團隊在結直腸癌的分子流行病學實踐中提出假設，位于MYC轉錄因子結合位點上的遺傳變異可能通過影響MYC的致癌功能從而改變腫瘤的易感性,。研究人員首先采用系統(tǒng)生物學研究策略整合ChIP-Seq, DNase-Seq和轉錄因子結合位點數(shù)據(jù),，挑選出潛在影響MYC結合的12個遺傳變異，然后通過多中心大樣本病例-對照研究（一共研究4830例病人：4759例對照）,，發(fā)現(xiàn)位于KBTBD11基因上游的rs11777210與腫瘤風險增高相關,，并且它與調(diào)控MYC自身表達的功能性遺傳變異rs6983267存在顯著的交互作用，同時攜帶兩種風險基因型的個體罹患結直腸癌的風險增加了2.85倍,。隨后的功能學實驗闡明了這種基因-基因交互作用的生物學機制：rs6983267提高MYC表達→轉錄因子MYC增加與rs11777210的結合→受MYC負調(diào)控的KBTBD11表達降低,，細胞凋亡實驗進一步證實KBTBD11可促進細胞凋亡，降低細胞增殖活性,，提示其抑癌基因特點,。因此，危險基因型攜帶者因為具有相對較高的癌基因MYC表達和較低的抑癌基因KBTBD11表達,，從而具有較高的結直腸癌遺傳易感性,。

　　腫瘤的發(fā)生發(fā)展受到多個基因和多種環(huán)境因素的共同影響，普遍存在復雜基因-基因,、基因-環(huán)境交互作用,。對于復雜交互作用的探索一直是腫瘤分子流行病學研究的熱點和難點。目前該團隊正試圖通過分子生物信息學篩結合人群流行病學大數(shù)據(jù)以及系統(tǒng)分子生物學功能實驗攻克相關難題,。

整合功能基因組學篩選方法以及人群功能驗證

　　論文出處：J Gong, J Tian, J Lou, X Wang, J Ke, J Li, Y Yang, Y Gong, Y Zhu, D Zou, X Peng, N Yang, S Mei, R Zhong, J Chang, X Miao; A polymorphic MYC response element in KBTBD11 influences colorectal cancer risk, especially in interaction with a MYC regulated SNP rs6983267, Annals of Oncology, , mdx789, https://doi.org/10.1093/annonc/mdx789